Historia Kroniki X zaczyna się po tym, jak ludzkość utraciła kontrolę nad Ziemią. Szarzy, obcy gatunek szpiegów i zabójców, sparaliżowali światowe rządy, siły zbrojne i infrastrukturę, zanim zadali decydujący cios w postaci inwazji na pełną skalę na całej planecie. Wszystko, co pozostaje, by rzucić wyzwanie Szarakom, to niewielka grupa żołnierzy, naukowców i terrorystów znana jako Kronika X. Gracze zdecydują, czy Kronika X zwycięży i ludzkość zostanie ocalona, czy też Szaraki zacieśnią uścisk i Ziemia zostanie utracona na zawsze.

Chronicle Xto gra planszowa dla 1–7 graczy z bardzo szczegółowymi miniaturami i złożonym systemem zasad, dzięki którym żadne dwie sesje rozgrywki nie będą takie same. Jeden z graczy wciela się w przerażającą Nadświadomość, wysokiego przywódcę armii najeźdźców z kosmosu, znanych tylko jako „Szaraki”. Pozostali gracze należą do Chronicle X, zróżnicowanej grupy wykwalifikowanych jednostek, zdeterminowanych, by ocalić swoją planetę przed nowym zagrożeniem ze strony obcych.

Gra zawiera opcję korzystania z AI Overmind, w którym to momencie staje się grą solową lub czysto kooperacyjną. W każdym trybie zawsze jest 6 postaci ludzkich, podzielonych między ludzkich graczy.